MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 1001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	TCAG	2	8	1319	1326	25 %	25 %	25 %	25 %	157149552
2	NC_009790	TTC	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149552
3	NC_009790	CGG	2	6	1398	1403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149552
4	NC_009790	GCC	2	6	1415	1420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149552
5	NC_009790	ATCC	2	8	1505	1512	25 %	25 %	0 %	50 %	157149552
6	NC_009790	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	157149552
7	NC_009790	CA	3	6	1546	1551	50 %	0 %	0 %	50 %	157149552
8	NC_009790	A	6	6	1589	1594	100 %	0 %	0 %	0 %	157149552
9	NC_009790	CTC	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149552
10	NC_009790	TGG	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149552
11	NC_009790	CTT	2	6	1745	1750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149552
12	NC_009790	TCT	2	6	1795	1800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149552
13	NC_009790	CCG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149552
14	NC_009790	CGT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149552
15	NC_009790	GCA	2	6	2184	2189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
16	NC_009790	TAA	2	6	2223	2228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149551
17	NC_009790	TATC	2	8	2242	2249	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
18	NC_009790	CAAA	2	8	2250	2257	75 %	0 %	0 %	25 %	157149551
19	NC_009790	TGA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
20	NC_009790	AAG	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149551
21	NC_009790	ACT	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149551
22	NC_009790	CAT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149551
23	NC_009790	TGA	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
24	NC_009790	TGA	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
25	NC_009790	AC	3	6	2649	2654	50 %	0 %	0 %	50 %	157149551
26	NC_009790	GAGGG	2	10	2719	2728	20 %	0 %	80 %	0 %	157149551
27	NC_009790	CCT	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149551
28	NC_009790	GAT	2	6	2872	2877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
29	NC_009790	GAC	3	9	2917	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
30	NC_009790	TTG	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149551
31	NC_009790	GCA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
32	NC_009790	AGTG	2	8	3108	3115	25 %	25 %	50 %	0 %	157149551
33	NC_009790	TGT	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149551
34	NC_009790	GGCT	2	8	3123	3130	0 %	25 %	50 %	25 %	157149551
35	NC_009790	GCA	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
36	NC_009790	ATA	2	6	3260	3265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149551
37	NC_009790	ATT	2	6	3273	3278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149551
38	NC_009790	TTAC	2	8	3323	3330	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
39	NC_009790	ATAA	2	8	3342	3349	75 %	25 %	0 %	0 %	157149551
40	NC_009790	AAT	2	6	3510	3515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149560
41	NC_009790	CAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149560
42	NC_009790	GAA	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149560
43	NC_009790	GTA	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149560
44	NC_009790	TGCC	2	8	3726	3733	0 %	25 %	25 %	50 %	157149560
45	NC_009790	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	157149560
46	NC_009790	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149560
47	NC_009790	TG	3	6	3883	3888	0 %	50 %	50 %	0 %	157149560
48	NC_009790	CTG	2	6	3964	3969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149560
49	NC_009790	A	6	6	3978	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	157149560
50	NC_009790	GCCGGA	2	12	4014	4025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149560
51	NC_009790	TAA	2	6	4026	4031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149560
52	NC_009790	TGT	2	6	4087	4092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149560
53	NC_009790	GCCG	2	8	4104	4111	0 %	0 %	50 %	50 %	157149560
54	NC_009790	TTA	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149560
55	NC_009790	AGC	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149560
56	NC_009790	TGA	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149560
57	NC_009790	TC	3	6	4197	4202	0 %	50 %	0 %	50 %	157149541
58	NC_009790	CTGG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	50 %	25 %	157149541
59	NC_009790	CTT	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149541
60	NC_009790	GAACG	2	10	4510	4519	40 %	0 %	40 %	20 %	157149541
61	NC_009790	CGCC	2	8	4584	4591	0 %	0 %	25 %	75 %	157149509
62	NC_009790	GGC	2	6	4668	4673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
63	NC_009790	GAA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149509
64	NC_009790	CCGG	2	8	4929	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	157149509
65	NC_009790	CCTG	2	8	4951	4958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149509
66	NC_009790	TGG	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149509
67	NC_009790	GATGT	2	10	4982	4991	20 %	40 %	40 %	0 %	157149509
68	NC_009790	CAG	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149509
69	NC_009790	TGT	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149509
70	NC_009790	CGT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149509
71	NC_009790	CTG	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149509
72	NC_009790	TGA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149509
73	NC_009790	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149509
74	NC_009790	CGG	2	6	5435	5440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
75	NC_009790	CCGGA	2	10	5458	5467	20 %	0 %	40 %	40 %	157149509
76	NC_009790	ATCC	2	8	5473	5480	25 %	25 %	0 %	50 %	157149509
77	NC_009790	GGT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149509
78	NC_009790	TGCA	2	8	5612	5619	25 %	25 %	25 %	25 %	157149509
79	NC_009790	CAC	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149509
80	NC_009790	CAG	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149509
81	NC_009790	GGC	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
82	NC_009790	CTG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149509
83	NC_009790	ACA	3	9	5888	5896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149509
84	NC_009790	GGT	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149509
85	NC_009790	GCG	2	6	5977	5982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
86	NC_009790	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149505
87	NC_009790	TAC	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149505
88	NC_009790	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149505
89	NC_009790	TTG	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149505
90	NC_009790	CAGC	2	8	6378	6385	25 %	0 %	25 %	50 %	157149505
91	NC_009790	GCAA	2	8	6402	6409	50 %	0 %	25 %	25 %	157149505
92	NC_009790	AGG	2	6	6414	6419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149505
93	NC_009790	CTG	2	6	6429	6434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149505
94	NC_009790	TGC	3	9	6472	6480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149505
95	NC_009790	A	7	7	6518	6524	100 %	0 %	0 %	0 %	157149505
96	NC_009790	AAG	2	6	6546	6551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149505
97	NC_009790	A	6	6	6571	6576	100 %	0 %	0 %	0 %	157149505
98	NC_009790	CGC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149528
99	NC_009790	GAT	2	6	6718	6723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149528
100	NC_009790	TCG	2	6	6780	6785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149528
101	NC_009790	GCT	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149528
102	NC_009790	CTG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149527
103	NC_009790	TGC	2	6	7175	7180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149527
104	NC_009790	ACC	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149518
105	NC_009790	AGA	2	6	7292	7297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149518
106	NC_009790	AGAA	2	8	7321	7328	75 %	0 %	25 %	0 %	157149518
107	NC_009790	GCA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149518
108	NC_009790	TCT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149518
109	NC_009790	A	7	7	7407	7413	100 %	0 %	0 %	0 %	157149518
110	NC_009790	CTT	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149518
111	NC_009790	TGT	2	6	7459	7464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149518
112	NC_009790	CTG	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149529
113	NC_009790	CTT	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149529
114	NC_009790	GCG	2	6	7998	8003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149529
115	NC_009790	GTA	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149529
116	NC_009790	TCA	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149529
117	NC_009790	TTC	2	6	8109	8114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149529
118	NC_009790	TGT	2	6	8132	8137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149529
119	NC_009790	TG	3	6	8233	8238	0 %	50 %	50 %	0 %	157149529
120	NC_009790	CGG	2	6	8278	8283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149529
121	NC_009790	TTCC	2	8	8324	8331	0 %	50 %	0 %	50 %	157149529
122	NC_009790	TCA	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149529
123	NC_009790	CAC	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149529
124	NC_009790	CTG	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149529
125	NC_009790	TG	3	6	8520	8525	0 %	50 %	50 %	0 %	157149529
126	NC_009790	GTGGCG	2	12	8659	8670	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157149555
127	NC_009790	CGA	3	9	8742	8750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149555
128	NC_009790	CTG	2	6	8788	8793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149555
129	NC_009790	GCCGGA	2	12	8910	8921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149555
130	NC_009790	GAA	3	9	8941	8949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149555
131	NC_009790	GAAC	2	8	8955	8962	50 %	0 %	25 %	25 %	157149555
132	NC_009790	ACG	2	6	8975	8980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149555
133	NC_009790	CTG	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149555
134	NC_009790	GTG	3	9	9091	9099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149555
135	NC_009790	GTG	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149555
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262	NC_009790	CAGC	2	8	19188	19195	25 %	0 %	25 %	50 %	157149535
263	NC_009790	ACGCC	2	10	19225	19234	20 %	0 %	20 %	60 %	157149535
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385	NC_009790	CGT	2	6	30198	30203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149546
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